Yui Hirasawa è appena diventata una ragazza delle superiori e non avendo mai avuto un vero hobby, cerca un club a cui iscriversi. Nello stesso tempo Ritsu Tainaka, batterista, e Mio Akiyama, bassista, cercano di salvare il club di musica leggera che sta svanendo a causa della mancanza di membri. Le due ragazze riescono a reclutare Tsumugi Kotobuki, pianista, ma manca ancora un membro per rendere il club attivo. Grazie ad un inaspettato incontro con le ragazze, Yui decide di iscriversi al club nonostante non sappia suonare uno strumento e conosca poco della musica. Incomincia così una divertente avventura composta da 4 ragazze con un'aspirazione in comune: Un live al Budokan tutto loro.

La storia si focalizza su Mirai, una studentessa delle medie che all'inizio delle vacanze estive si dirige sull'isola artificale di Odaiba, a Tokyo, assieme a suo fratello Yutaka per un'esibizione di robot. I loro programmi saranno totalmente stravolti quando dalla terra si sprigionerà una terrificante scossa sismica in grado di distruggere la famosa Tokyo Tower e il Rainbow Bridge, cambiando in un istante il paesaggio della Capitale. Con l'aiuto di Mari, che i due incontrano a Odaiba, Mirai e Yutaka cercano di tornare nella loro Setagaya, nella Tokyo occidentale.

L'anime tratta della storia di 3 sorelle, Chiaki, Kana e Haruka, illustrando la loro vita tra situazioni casalinghe e scolastiche. La storia viene nel corso dei capitoli riempita con l'aggiunta di vari personaggi, tra i molti compagni di classe ed i familiari delle ragazze. A partire dal gennaio 2008 è iniziata in patria Minami-ke: Okawari (みなみけ〜おかわり〜, La famiglia Minami: Secondo?), la cui produzione venne affidata ad un differente studio, lo Studio Asread, con un relavito cambio di stile nella cura dei disegni e dei personaggi, nonostante rimasero intatti i seiyuu dei personaggi. Anche questa serie consta di 13 episodi, trasmessi tra gennaio e marzo dello stesso anno.